Аппарат Государственной налоговой службы при Министерстве экономики:
- Главное управления налоговыми рисками
- Главное управление по работе с административными жалобами
- Главное управление налоговой проверки
- Главное управление налоговой политики
- Главное управление цифрового налогового администрирования
- Главное управление международного налогообложения и налогового мониторинга
- Главное управление контроля деклараций и камеральных налоговых проверок
- Главное управление экономического анализа и контроля реализации прогнозов
- Главное управление права
- Главное управление внутренней безопасности
- Главное управление человеческих ресурсов
- Главное управление по оказанию услуг налогоплательщикам
- Главное управление финансов
- Главное управление документооборота и контроля исполнительской дисциплины (Секретариат)
- Главное управление координации деятельности местных структур
- Главное управление регистрации и учета налогоплательщиков
- Главное управление контроля за исполнением налоговых обязательств
- Главное управление службы налогового омбудсмена
- Управление медии и коммуникаций
- Отдел финансового мониторинга
- Отдел управления проектами
- Секретный отдел
- Отдел информационной безопасности
- Протокольный отдел
Учреждения, входящие в структуру Государственной налоговой службы при Министерстве экономики:
- Главное управление организации оперативного налогового контроля и учета города Баку
- Главное управление национальных доходов
- Главное управление локальных доходов города Баку
- Главное управление по контролю за импортно-экспортными операциями
- Главное управление по контролю за оборотом акцизных и маркируемых товаров
- Главное управление по предварительному расследованию налоговых преступлений
- Главное Управление по управлению обязательствами
- Территориальные налоговые главные управления и управления
Подчиненное учреждение, не входящее в структуру Государственной налоговой службы при Министерстве экономики:
- Учебный центр